झेजियाङ प्रान्तमा ब्रुसेला एबोर्टसको पहिलो पूर्ण-जीनोम-आधारित ट्रेसेबिलिटी विश्लेषण - म्याक्रो र माइक्रो-टेस्टको बायोइन्फर्मेटिक्स टोलीले संयुक्त प्रकाशनमा योगदान पुर्‍याउँछ।

—— झेजियाङ सीडीसी, म्याक्रो एण्ड माइक्रो-टेस्ट, र चाइना सीडीसी द्वारा गरिएको सहकार्यात्मक अध्ययन फ्रन्टियर्स इन सेलुलर एण्ड इन्फेक्सन माइक्रोबायोलोजीमा प्रकाशित

अध्ययनको सिंहावलोकन

मे २०२६ मा, फ्रन्टियर्स इन सेलुलर एण्ड इन्फेक्सन माइक्रोबायोलोजी (JCR Q1, IF ≈ 4.6) ले झेजियाङ प्रान्तीय रोग नियन्त्रण तथा रोकथाम केन्द्र (झेजियाङ सीडीसी) को नेतृत्वमा बेइजिङ म्याक्रो एण्ड माइक्रो-टेस्ट बायो-टेक कम्पनी लिमिटेड र राष्ट्रिय सञ्चार रोग नियन्त्रण तथा रोकथाम संस्थान (चीन सीडीसी) को बायोइन्फर्मेटिक्स टोलीलाई सह-लेखकको रूपमा प्रस्तुत गर्दै एउटा पेपर प्रकाशित गर्‍यो। अध्ययनको शीर्षक छ:
"चीनको झेजियाङमा सात ब्रुसेला एबोर्टस प्रजातिहरूको पहिचान र फाइलोजेनेटिक विश्लेषण।"

यो अध्ययनले चीनको झेजियाङ प्रान्तमा ब्रुसेला एबोर्टस (बी. एबोर्टस) को पहिलो व्यवस्थित, पूर्ण-जीनोम-आधारित फाइलोजेनेटिक ट्रेसेबिलिटी विश्लेषणलाई प्रतिनिधित्व गर्दछ। टोलीले २०१५ देखि २०२५ सम्म सङ्कलन गरिएका सात आइसोलेटहरू (जिनहुआ, क्व्झाउ र निङ्बोबाट चार मानव-उत्पत्ति र तीन गोवंश-उत्पत्ति स्ट्रेनहरू) विश्लेषण गर्‍यो। निष्कर्षहरूले पूर्वी चीनको एक असामान्य दक्षिणी महामारी क्षेत्रमा यो "उत्तरी प्रमुख प्रजाति" को उत्पत्ति र प्रसारण मार्गहरूको लागि जीनोमिक प्रमाण प्रदान गर्दछ।

पृष्ठभूमि र महत्व

ब्रुसेलोसिस ब्रुसेला जातको ब्याक्टेरियाबाट हुने जुनोटिक रोग हो। ब्रुसेला एबोर्टसले मुख्यतया गाईवस्तुलाई संक्रमित गर्छ तर मानिसहरूमा पनि रोग निम्त्याउन सक्छ। चीनमा, ब्रुसेलोसिसले उल्लेखनीय भौगोलिक भिन्नता देखाउँछ: सबैभन्दा बढी घटना उत्तरी प्रान्तहरूमा हुन्छ (जस्तै, भित्री मंगोलिया, शान्सी, हेइलोङजियाङ)। यसको विपरीत, झेजियाङ सहित दक्षिणी प्रान्तहरूमा ऐतिहासिक रूपमा ब्रुसेला मेलिटेन्सिसको प्रभुत्व रहेको छ, जहाँ बी. एबोर्टसका धेरै कम केसहरू रिपोर्ट गरिएका छन्। यो क्षेत्रीय असमानताले झेजियाङमा बी. एबोर्टसको आनुवंशिक विशेषता र स्रोत ट्रेसिङलाई प्रमुख सार्वजनिक स्वास्थ्य प्राथमिकता बनाउँछ।

विधिहरू र प्रमुख निष्कर्षहरू

अनुसन्धान टोलीले आणविक जीवविज्ञान र जैव सूचना विज्ञानलाई संयोजन गर्ने बहुआयामिक रणनीति अपनायो:

1.रोगजनक पहिचान र आधारभूत टाइपिङ

BCSP-31 जीन PCR र AMOS-PCR ले पुष्टि गर्‍यो कि सबै सात आइसोलेटहरू B. abortus थिए।

नौ हाउसकिपिङ जीनहरूमा आधारित मल्टिलोकस सिक्वेन्स टाइपिङ (MLST) ले सबै आइसोलेटहरू सिक्वेन्स प्रकार ST2 का भएको पत्ता लगायो, जसले झेजियाङमा परिसंचरण हुने B. abortus स्ट्रेनहरूमा उच्च आनुवंशिक एकरूपतालाई संकेत गर्दछ।

2.पूर्ण-जीनोम विशेषता चित्रण

इलुमिना नोभासेक प्लेटफर्ममा सम्पूर्ण-जीनोम अनुक्रमण गरिएको थियो। औसत न्यूक्लियोटाइड पहिचान (एएनआई) विश्लेषणले देखाएको छ कि झेजियाङ आइसोलेट्सले सन्दर्भ स्ट्रेन बी. एबोर्टस ५४४ सँग ९९.९९% सम्म समानता साझा गरेको छ।

पान-जीनोम विश्लेषणले अत्यधिक संरक्षित जनसंख्या पत्ता लगायो: ३,०८४ कोर जीनहरू पहिचान गरियो, केवल १० शेल जीनहरू सहित, र कुनै सफ्ट कोर वा क्लाउड जीनहरू पत्ता लागेनन्।

3.विषाणु र एन्टिमाइक्रोबियल प्रतिरोध जीन प्रोफाइलहरू

LPS बायोसिन्थेसिस, T4SS स्राव प्रणाली, र BvrR-BvrS दुई-घटक नियामक प्रणाली जस्ता शास्त्रीय मार्गहरूलाई समेटेर कुल ६८ विषाणु-सम्बन्धित कारकहरूको भविष्यवाणी गरिएको थियो। उल्लेखनीय रूपमा, सबै आइसोलेटहरूमा bmaA र btaF adhesin जीनको अभाव थियो। प्रतिरोध जीन विश्लेषणले CARD डाटाबेसमा mprF जीन मात्र पत्ता लगायो, अन्य कुनै प्रतिरोध निर्धारकहरू पहिचान गरिएको थिएन।

४.फाइलोजेनेटिक पुनर्निर्माण र प्रसारण ट्रेसिङ

कोर-जीनोम सिंगल-न्यूक्लियोटाइड पोलिमोर्फिज्म (cgSNP) विश्लेषणले झेजियाङ आइसोलेटहरूलाई विश्वव्यापी फाइलोजेनेटिक रूखमा एक विशिष्ट स्थानमा राख्यो। नतिजाहरूले देखाए कि झेजियाङ स्ट्रेनहरूले रूस, मंगोलिया र धेरै उत्तरी चिनियाँ प्रान्तहरू (निङ्जिया, हेइलोङजियाङ, भित्री मंगोलिया, हेबेई, गान्सु, बेइजिङ) बाट स्ट्रेनहरूसँग मिलेर एक मोनोफाइलेटिक समूह बनाउँछन्। यो समूह थप तीन फरक उप-क्लेडहरूमा विभाजित हुन्छ (क्लेड १-३), जसले धेरै स्वतन्त्र परिचय घटनाहरू सुझाव दिन्छ।

निष्कर्ष र प्रभावहरू

यो अध्ययनले झेजियाङ प्रान्तमा बी. एबोर्टसको पहिलो उच्च परिशुद्धता जीनोमिक डेटासेट प्रदान गर्दछ र धेरै प्रमुख निष्कर्षहरू निकाल्छ:

1. क्लेar आनुवंशिक पृष्ठभूमि– झेजियाङमा फैलिएको B. abortus प्रजाति ST2 मा पर्छन्, जीनोमिक रूपमा अत्यधिक संरक्षित छन्, र एक विशिष्ट गाईवस्तु ब्रुसेलोसिस वंशको प्रतिनिधित्व गर्छन्।

2. एभीक्रस रिजनल ट्रान्समिसनको औचित्य- फाइलोजेनेटिक विश्लेषणले झेजियाङमा स्वतन्त्र स्थानीय वंशको अस्तित्वलाई समर्थन गर्दैन। बरु, तथ्याङ्कले दृढतापूर्वक सुझाव दिन्छ कि यी प्रजातिहरू उत्तरी चीनबाट उत्पन्न भएका हुन् र रूस र मंगोलियाका प्रजातिहरूसँग साझा विकासवादी पृष्ठभूमि साझा गर्न सक्छन्। तीन उप-क्लेडहरूको उपस्थितिले धेरै अलग-अलग परिचय घटनाहरूलाई जनाउँछ।

3. जनस्वास्थ्यमा पर्ने प्रभावहरू– यी निष्कर्षहरूले झेजियाङ जस्ता परम्परागत रूपमा गैर-स्थानीय क्षेत्रहरूमा पनि ब्रुसेलोसिसको लागि जीनोमिक निगरानीको महत्त्वलाई जोड दिन्छन्। यद्यपि हालको केस गणना कम छ, cgSNP जस्ता उच्च रिजोल्युसन उपकरणहरूले आयातित प्रकोपको स्रोतलाई प्रभावकारी रूपमा पत्ता लगाउन सक्छन् र अन्तर-प्रान्तीय पशुधन यातायातसँग सम्बन्धित प्रसारण श्रृंखलाहरू अवरोध गर्न वैज्ञानिक प्रमाण प्रदान गर्न सक्छन्।

यो कार्यले झेजियाङ प्रान्तमा अनुसन्धानको खाडल मात्र भर्दैन तर याङ्त्जे नदी डेल्टा क्षेत्रमा रोगजनक निगरानी र ब्रुसेलोसिसको जोखिम मूल्याङ्कनको लागि नयाँ आधारभूत डेटा पनि प्रदान गर्दछ।

कागज जानकारी:
याङ, वाई., शि, एक्स., चेन, जे., वाङ, एल., वू, जेड., याओ, डब्ल्यू., ... र वू, बी. (२०२६)। चीनको झेजियाङमा सात ब्रुसेला एबोर्टस स्ट्रेनहरूको पहिचान र फाइलोजेनेटिक विश्लेषण। फ्रन्टियर्स इन सेलुलर एण्ड इन्फेक्सन माइक्रोबायोलोजी, १६, १७५८९६५।